En 1947 el equipo no pudo conseguir el bicampeonato y finalizó segundo a siete puntos de Colo-Colo. La mejor actuación de Audax en la década de 1960 se vio en el campeonato de 1968, en el que finalizó en sexta posición a diez puntos del campeón Santiago Wanderers. Ladislao Pakozdi al quedar en primer lugar con 34 puntos, tres más que su más cercano perseguidor, la Universidad de Chile.